1.办公室：负责单位日常事务工作。综合协调、调度机关内外的政务。机关文字材料的起草、印发及整理归档；议案、提案、信息的处理；重要会议、重大活动的组织协调和日常接待工作等。

2.外国投资管理科：指导和推进全市利用外资工作。

3.对外贸易科：负责全市进出口工作宏观管理和协调服务工作。

4.对外投资和经济合作科：依法管理和监督对外投资、对外承包工程、对外劳务合作等对外合作业务。

5.商务稽查科（挂市商务行政执法大队牌子）：牵头组织商务行政执法，负责餐饮业、住宿业、国内展览业等商贸服务业的行业管理。

6.商贸服务科：负责商务领域内成品油、拍卖、典当、废旧汽车回收拆解、二手车市场交易评估等企业经营、资格许可证的预审及再生资源等企业的备案登记管理；监测、分析市场运行和商品供求状况；承担重要消费品（肉类、糖类、小包装食品等）储备管理和市场调控有关工作。

7.电子商务科：指导全市电子商务发展。

8.招商科：承担与国内外各类投资机构、商务机构联系工作，做好项目信息的收集、汇总、储备、更新、推进工作及各类投资考察团组及人员接待工作；组织全市招商人员业务培训、招商引资调研等工作。